标签和读写器间的通信协议的标准化规格正在由国际标准化组织ISO进行制定。作为已经确定的标准有ISO14443、ISO15693和ISO18000等种类。 
其中ISO14443和ISO15693同时为13.56MHz频带所利用。ISO14443是关于认证和电子货币那样保密程度高的情况下利用RFID或非接触的IC卡的通信标准。主要有Type A(IC电话卡等)，Type B（身份证件等），Type C(FeliCa)的三种。ISO15693是以作为商品等目的来应用为前提的RFID通信规格。规定了内存的读写等基本指令却没有规定密码化等保密机能。 
近来，ISO又制定和公布了ISO 18000标准，这个标准写入了包括在供应链中用于货物跟踪的空中接口协议。ISO18000兼顾了世界上的七种RFID的主要频段标准。ISO14443和ISO15693以及这七种标注的内容汇总如下： 
国际标准化组织（ISO）还制订出有关动物跟踪的RFID标准。 
ISO11784详细说明了标签数据的构成方式。 
ISO11785定义了空中接口协议。 
ISO还建立了测试RFID标签与读卡机一致性的标准(ISO 18047)，和测试RFID标签与读卡机性能的标准(ISO 18046)。 
有关在供应链中利用RFID来进行货物跟踪的标准很少。ISO提议探讨有关四十英尺海运集装箱、托盘、运输工具、具体案例等特殊条款